При расчёте стоимости системы должны учитываются следующие необходимые работы и затраты, зависящие от масштабов лечебного учреждения и его оснащённости:

• обследование лечебного учреждения и разработка проекта технического задания на создание МАИС;
• выполнение проектных работ;
• установка и настройка программных средств;
• обучение медицинского персонала;
• обеспечение эксплуатации программных средств.

Процесс установки и настройки программных средств включает следующие операции:

• установка программного и информационного обеспечения системы;
• настройка (доработка) справочников;
• настройка (доработка) отчетных форм и отчетной документации;
• доработка/разработка нового (при необходимости) программного обеспечения по заявкам заказчика;
• настройка профилей в соответствии с пожеланиями конкретных пользователей системы;
• практическое обучение пользователей системы;
• практическая отработка технологических процессов.